ההבדל העיקרי - cDNA לעומת DNA גנומי

DNA משלים (cDNA) ו- DNA גנומי הם שני סוגים של מולקולות DNA המשמשות בניסויי המחקר בביולוגיה מולקולרית. הן cDNA והן DNA גנומי מורכבים מנוקלאוטידים של DNA. cDNA מיוצר על ידי שעתוק הפוך של ה- RNA המופק מרקמה. סוגי ה- RNA המשמשים את התעתיק ההפוך יכולים להיות RNA כולל, pre-mRNA, RNA, RNA ריבוזומלי או tRNA. עם זאת, ניתן לבודד DNA גנומי ישירות מהתא. ה ההבדל העיקרי בין cDNA ל- DNA גנומי זה cDNA מייצג את התעתיק של אורגניזם מסוים ואילו ה- DNA הגנומי מייצג את הגנום.

אזורי מפתח מכוסים

1. מהו cDNA - הגדרה, עובדות, תפקיד 2. מהו DNA גנומי - הגדרה, עובדות, תפקיד 3. מה הדמיון בין cDNA ל- DNA גנומי - מתווה של תכונות נפוצות 4. מה ההבדל בין cDNA ל- DNA גנומי - השוואה בין הבדלים מרכזיים

מונחי מפתח: DNA משלים (cDNA), גנום, DNA גנומי (gDNA), תמלול הפוך, RNA, טרנסקריפטום

מהו cDNA

cDNA (DNA משלים) מתייחס ל- DNA הסינתטי שרצפי הבסיס שלו משלימים את ה- DNA. הוא מיוצר מהשעתוק ההפוך של תבניות RNA. ניתן להשתמש בסה"כ RNA, טרום mRNA, RNA, RNA ריבוזומלי או tRNA לצורך שעתוק הפוך. טרנסקריפטאז הפוך הוא האנזים שמזרז את התגובה של ייצור cDNA מ- RNA. התעתיק ההפוך יחד עם PCR מוצג באיור 1.

איור 1: תמלול הפוך בשילוב עם PCR

cDNA משמש בעיקר בשיבוט גנים אוקריוטים בגנום הפרוקריוטי. אקסונים מורכבים מאזור הקידוד של החלבונים. באיקריוטים, אזור הקידוד נקטע על ידי אינטרונים. במהלך השעתוק, האינטרונים והאקסונים מקודדים ל- mRNA טרום. אך במהלך עיבוד ה- mRNA, האיטרונים מוסרים מ- mRNA, ומייצרים mRNA בוגר על ידי שחבור האקסונים יחדיו. סך ה- mRNA של אורגניזם נקרא transcriptome. עם זאת, לפרוקריוטים חסרים מנגנוני עיבוד mRNA. לפיכך, mRNA משמש לסינתזת cDNA המכיל רק אזורי קידוד חלבונים בגנום. CDNA זה משמש לשבוט גנים לפרוקריוטים. cDNA מיוצר באופן טבעי ברטרו -וירוסים במהלך המרת גנום ה- RNA ל- DNA.

מהו DNA גנומי

DNA גנומי (gDNA) מתייחס לקבוצה הכוללת של ה- DNA הכרומוזומלי בגנום. מכלול הגנים של אורגניזם מסוים מכונה הגנום שלו. עם זאת, לא רק הגנים של הגנום פעילים. לרוב קבוצות האורגניזמים יש סוגים דומים של DNA גנומי בתוך הקבוצה. הגנום של האורגניזם מועבר מהדור הבא לדור השני. באופן כללי, הגנום מורכב ממספר רב של זוגות בסיס. כדוגמה, הגנום האנושי מורכב מכ -3 מיליארד זוגות בסיס. הכרומוזומים של הגנום האנושי מוצגים באיור 2.

איור 2: כרומוזומים של הגנום האנושי

ארבעת סוגי הרצפים המצויים בדנ"א הגנומי הם גנים המקודדים חלבון, גנים שחוזרים במקביל, DNA שחוזר על עצמו ו- DNA מרווח. DNA גנומי משמש בניסויים רבים בביולוגיה מולקולרית. הבידוד של ה- DNA הגנומי קל בהשוואה להכנת cDNA. ניתן להשתמש ב- DNA גנומי כתבניות PCR, בשיבוט, רצף, הכנת ספריות גנומיות, טביעת אצבע DNA, לימוד מבני גנים וזיהוי מוטציות/חריגות.

קווי דמיון בין cDNA ל- DNA גנומי

ההבדל בין cDNA ל- DNA גנומי

הַגדָרָה

cDNA: cDNA הוא ה- DNA הסינתטי שרצפי הבסיס שלו משלימים את ה- DNA הגנומי.

DNA גנומי: DNA גנומי הוא הסט הכולל של ה- DNA הכרומוזומלי בגנום.

לְיַצֵג

cDNA: cDNA מייצג את התעתיק.

DNA גנומי: DNA מייצג את הגנום.

מסונתז/מופק מתוך

cDNA: cDNA מסונתז מהשעתוק ההפוך של סוגים שונים של RNA.

DNA גנומי: ניתן לחלץ DNA גנומי מגנום קיים.

תוֹכֶן

cDNA: cDNA מורכב מאקסונים או מאזורי קידוד.

DNA גנומי: DNA גנומי מורכב מרצפים מקודדים ולא מקודדים של אורגניזם.

כַּמוּת

cDNA: cDNA מכיל כמה זוגות בסיס.

DNA גנומי: DNA גנומי מכיל מספר רב של זוגות בסיס.

להשתמש

cDNA: cDNA משמש לייצור ספריות cDNA.

DNA גנומי: ניתן להשתמש ב- DNA גנומי לייצור ספריות גנומיות.

סיכום

cDNA ו- DNA גנומי הם שני סוגים של מולקולות DNA המשמשות בסוגים שונים של ניסויים בביולוגיה מולקולרית. cDNA מסונתז מ- RNA, והוא מורכב רק מאקסונים. לכן, הוא מייצג את התעתיק של אורגניזם. ניתן להפיק DNA גנומי בקלות מגרעין התא. הוא מורכב מאזורי קידוד ומאזורים שאינם מקודדים. הוא מייצג את הגנום של אורגניזם מסוים. ההבדל העיקרי בין cDNA ל- DNA גנומי הוא סוג ה- DNA הקיים בכל סוג של מולקולות DNA.

התייחסות:

1. "CDNA (DNA משלים)." גנים אנושיים, זמינים כאן.2. "GDNA - DNA גנומי | אנליטי מתקדם (AATI). ” Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), זמין כאן.3. "בידוד DNA יישומי ויישומים." Scribd, זמין כאן.

באדיבות התמונה:

1. "תגובת שרשרת פולימראז של תעתיק הפוך" מאת Jpark623-עבודה משלו (CC BY-SA 3.0) באמצעות Commons Wikimedia2. "גנום אנושי לגנים" (CC BY 2.0) באמצעות Commons Wikimedia