ההבדל העיקרי - Deoxyribose לעומת Ribose

חומצה Deoxyribonucleic (DNA) וחומצה ריבונוקלאית (RNA) הן מולקולות ביולוגיות חיוניות של החיים על פני כדור הארץ. כל יצור חי משתמש ב- DNA כעמוד השדרה הגנטי שלהם. ניתן למצוא DNA בגרעין התא באיקריוטים, והוא מכוון את כל הפעילות התאית על ידי הקצאתו ל- RNA. ל- RNA תפקידים ביולוגיים מגוונים בגוף האדם כגון קידוד, פענוח, ויסות והבעה של גנים. הוא מעביר מסרים מתוך גרעין התא לציטופלזמה. ניתן למצוא ריבוזה ב- RNA, והיא תרכובת אורגנית או במדויק, חד -סוכר פנטוז. Deoxyribose הוא חד סוכרי שמשתתף ביצירת DNA. זהו סוכר דיאוקסי שמקורו בריבוז הסוכר על ידי אובדן אטום חמצן. זה ההבדל העיקרי בין Deoxyribose ו Ribose. במאמר זה, בואו נפרט את ההבדל בין ריבוז לדאוקסיריבוזה מבחינת השימוש בהם, כמו גם תכונות כימיות ופיזיקליות.

מהו ריבוזה

ריבוז הוא חד סוכר פנטוז או סוכר פשוט עם הנוסחה הכימית של C₅ח₁₀או₅. יש לזה שני אנטיומרים; D-ribose ו- L-ribose. למרות זאת, D- ריבוזה מתרחשת באופן נרחב בטבע, אבל L- ריבוזה אינו מקורו בטבע. ריבוזה התגלה לראשונה על ידי אמיל פישר בשנת 1891. ה- β-D-ribofuranose הריבוז נחשב כעמוד השדרה של ה- RNA. הוא מקושר ל deoxyribose, שמקורו ב- DNA. בנוסף, למוצרי ריבוזת זרחנית כגון ATP ו- NADH יש תפקידים דומיננטיים בחילוף החומרים התאי.

מהו Deoxyribose

Deoxyribose הוא חד סוכר פנטוז או סוכר פשוט עם הנוסחה הכימית של C₅ח₁₀או₄. שמו מציין שמדובר בסוכר דהוקסי. זה נובע מהריבוז הסוכר על ידי אובדן אטום חמצן. יש לזה שני אנטיומרים; D-2-deoxyribose ו- L-2-deoxyribose. למרות זאת, D-2-deoxyribose מתרחשת באופן נרחב בטבע, אבל L-2-deoxyribose לעתים רחוקות מקורם בטבע. הוא התגלה בשנת 1929 על ידי פואבוס לוין. D-2-deoxyribose הוא המבשר העיקרי של ה- DNA של חומצת הגרעין (חומצה deoxyribonucleic).

ההבדל בין Deoxyribose ו Ribose

ניתן לחלק את ההבדלים בין ריבוז לדאוקסיריבוזה לקטגוריות הבאות. הם;

הַגדָרָה

ריבוזה הוא אלדו-פנטוז או, במילים אחרות, חד-סוכר המכיל חמישה אטומי פחמן. כפי שמוצג באיור 1, בצורתו בשרשרת פתוחה, יש לו קבוצה תפקודית של אלדהיד בקצה אחד.

Deoxyribose, או ליתר דיוק 2-deoxyribose, הוא חד-סוכר, ושמו מעיד כי מדובר בסוכר deoxy, כלומר הוא נגזר מהריבוז הסוכר על ידי אובדן אטום חמצן אחד.

מבנה כימי

ריבוזה

איור 1: נוסחה מולקולרית של ריבוזה

Deoxyribose

איור 2: נוסחה מולקולרית של Deoxyribose

נוסחה כימית

הנוסחה הכימית של ריבוזה הוא ג₅ח₁₀או₅.

הנוסחה הכימית של Deoxyribose הוא ג₅ח₁₀או₄.

מסה מולארית

המסה המולקולרית של ריבוזה 150.13 גרם/מול.

המסה המולקולרית של Deoxyribose 134.13 גרם · מול⁻¹

שם IUPAC

שם IUPAC של ריבוזה הוא (2S, 3R, 4S, 5R) -5- (hydroxymethyl) oxolane-2, 3, 4-triol.

שם IUPAC של Deoxyribose הוא 2-deoxy-D-ribose.

שמות אחרים

ריבוזה ידוע גם בשם D-Ribose.

Deoxyribose ידוע גם בשם 2-deoxy-D-erythro-pentose, thyminose.

הִיסטוֹרִיָה

ריבוזה התגלה בשנת 1891 על ידי אמיל פישר.

Deoxyribose התגלה בשנת 1929 על ידי פואבוס לוין.

חשיבות ביולוגית

ה- D-ריבוזה יוצר חלק מעמוד השדרה של RNA. RNA מעורב בעיקר בסינתזת החלבון החשובה ביולוגית. בנוסף, מוצרים ריבוזיים זרחנים הכוללים ATP ו- NADH ממלאים תפקידים מרכזיים בחילוף החומרים התאי כגון נשימה, פוטוסינתזה, רבייה וכו '. AMP ו- GMP מחזוריים, הנגזרים מ- ATP ו- GTP, מתפקדים כשליחים משניים בכמה נתיבי איתות.

Deoxyribose למוצרים תפקיד משמעותי בביולוגיה. מולקולת ה- DNA היא המקור העיקרי למידע גנטי בכל חיים וחיים, הכוללת שרשרת ארוכה של יחידות המכילות דיוקסיריבוזות המכונות נוקלאוטידים, המחוברות באמצעות קבוצות פוספט. נוקלאוטיד ה- DNA מורכב מבסיסים אורגניים כגון אדנין, תימין, גואנין או ציטוזין. היעדר קבוצת ההידרוקסיל 2 'בדאוקסיריבוז אחראי למעשה לגמישות המכנית המוגברת של ה- DNA בהשוואה ל- RNA. בנוסף, גמישות מכנית זו מאפשרת לה גם להניח את הקונפורמציה של הסליל הכפול, ולהיות מפותלת ביעילות ומסודרת בתוך גרעין התא הקטן.

לסיכום, הן ריבוז והן דאוקסיריבוזה חשובים בעיקר לייצור RNA ו- DNA. בנוסף, תרכובות כימיות אלו ישתתפו במנגנונים ביולוגיים בעלי ערך בגוף האדם.

הפניות

C.Bernelot-Moens ו- B. Demple, (1989), פעילויות תיקון DNA מרובות עבור שברי 3-deoxyribose ב- Escherichia coli. מחקר חומצות גרעין, כרך 17, גיליון 2, עמ '. 587–600.

מדד מרק: אנציקלופדיה לכימיקלים, סמים וביולוגים (מהדורה 11), מרק, 1989, ISBN 091191028X, 2890

וויסט, רוברט סי, עורכת. (1981). מדריך ה- CRC לכימיה ולפיזיקה (מהדורה 62). בוקה רטון, פלורידה: הוצאת CRC. עמ. C-506. ISBN 0-8493-0462-8.

באדיבות התמונה:

"D-Ribose" מאת Edgar181-עבודה משלו. (נחלת הכלל) באמצעות Commons

"שרשרת D-dexoyribose" מאת Physchim62- עבודה משלה. (CC BY 3.0) באמצעות Commons

"מבנה כימי של ריבוז ודאוקסיריבוזה" מאת גנטיקה חינוך (CC BY 2.0) באמצעות פליקר